W styczniu 2007 roku w Urzędzie Miasta Krakowa powstało Biuro Funduszy Europejskich. Jego podstawowym zadaniem była koordynacja, monitorowanie oraz nadzór nad przygotowaniem projektów przez wydziały i jednostki organizacyjne Urzędu Miasta oraz nad zgłoszeniem ich do dofinansowania ze źródeł zewnętrznych.
W wyniku reorganizacji Urzędu Miasta Krakowa, od dnia 1 stycznia 2019 roku rozpoczął działalność Wydział Strategii, Planowania i Monitorowania Inwestycji, w skład którego wszedł Referat Funduszy Europejskich. Podstawowym celem tego referatu jest skuteczna koordynacja procesu pozyskiwania i wykorzystywania środków unijnych na realizację projektów zarówno inwestycyjnych jak i nieinwestycyjnych, których beneficjentem jest Gmina Miejska Kraków.
Wydział Strategii, Planowania i Monitorowania Inwestycji w strukturze organizacyjnej UMK:
II Zastępca Prezydenta ds. Zrównoważonego Rozwoju
Dyrektor Wydziału Strategii, Planowania i Monitorowania Inwestycji
Podział na wewnętrzne komórki organizacyjne oraz szczegółowy zakres działania Wydziału Strategii, Planowania i Monitorowania Inwestycji reguluje Zarządzenie PMK nr 3533/2018.
Z dokumentu tego wynikają następujące zadania Referatu Funduszy Europejskich w odniesieniu do projektów unijnych:
W zakresie działań o charakterze informacyjno – szkoleniowym Referat Funduszy Europejskich organizuje bądź współorganizuje szkolenia i konferencje o tematyce związanej z przygotowaniem i realizacją projektów dofinansowywanych ze źródeł zewnętrznych. Uczestnikami szkoleń są głównie osoby odpowiedzialne za przygotowanie i realizację projektów oraz kadra kierownicza komórek organizacyjnych, w których te projekty powstają i są realizowane.